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17.1: Biotecnologia - Biologia

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17.1: Biotecnologia

Técnicas básicas para manipular material genético (DNA e RNA)

Para entender as técnicas básicas usadas para trabalhar com ácidos nucléicos, lembre-se de que os ácidos nucléicos são macromoléculas feitas de nucleotídeos (um açúcar, um fosfato e uma base nitrogenada) ligados por ligações fosfodiéster. Cada um dos grupos fosfato nessas moléculas tem uma carga líquida negativa. Um conjunto completo de moléculas de DNA no núcleo é denominado genoma. O DNA tem duas fitas complementares ligadas por pontes de hidrogênio entre as bases emparelhadas. As duas fitas podem ser separadas por exposição a altas temperaturas (desnaturação do DNA) e podem ser reanimadas por resfriamento. O DNA pode ser replicado pela enzima DNA polimerase. Ao contrário do DNA, que está localizado no núcleo das células eucarióticas, as moléculas de RNA deixam o núcleo. O tipo mais comum de RNA que é analisado é o RNA mensageiro (mRNA) porque representa os genes codificadores de proteínas que são expressos ativamente. No entanto, as moléculas de RNA apresentam alguns outros desafios para a análise, pois muitas vezes são menos estáveis ​​do que o DNA.


Programas básicos de laboratório

Na Modern Biology, nós nos esforçamos para fornecer aos educadores as ferramentas de que precisam para inspirar os alunos a abraçar as ciências com entusiasmo. Oferecemos experimentos predefinidos específicos para a classe que envolvem os alunos, permitindo-lhes realizar experimentos autênticos e significativos. Quer você lecione no ensino médio ou em uma faculdade, a Biologia Moderna está sempre pronta para ajudá-lo a encontrar novas maneiras de inspirar seus alunos.

Nossos programas experimentais completos
A Biologia Moderna oferece vários programas experimentais completos em várias disciplinas. Esses programas prontos para o aluno são adequados como um currículo para aulas básicas a mais intensas. Os experimentos incluídos em nossos programas Experimentais Completos vêm com suprimentos suficientes para oito pares de parceiros de laboratório, bem como manuais para o instrutor e os alunos. Alguns programas têm a opção de solicitar várias sessões de laboratório para economia de dinheiro e recargas de consumíveis.

Também disponibilizamos vários cursos laboratoriais completos adequados para cursos introdutórios em nível de faculdade. Estes incluem Biologia Geral, Biologia Celular, Biologia Molecular, Biologia Molecular Abrangente e Introdução à Biologia Celular e Molecular.

Nossos experimentos baseados em classe
Tornamos mais simples encontrar o material relevante para as aulas que você ministra com nossas categorias de experimentos baseados em aulas. Economize tempo pesquisando rapidamente por disciplina ou nível de aluno.

  • Os experimentos no nível do ensino médio são projetados com grande atenção à habilidade do aluno e às instalações e equipamentos de um laboratório de ciências típico do ensino médio.
  • As categorias Advanced High School e AP Biology vão além dos experimentos padrão do High School para ajudar a preparar os alunos para aulas de laboratório de nível universitário.
  • Nossos experimentos em nível de General College são apropriados para o ensino de biologia em um ambiente de ensino superior.

Equipamento de laboratório para escolas
Além de transportar uma grande variedade de experimentos, também vendemos os equipamentos e suprimentos essenciais de que você precisa para concluir o laboratório da sua escola. Todos os nossos equipamentos vêm de fabricantes confiáveis ​​por anos de uso confiável do aluno.

Queremos que você se sinta confiante ao comprar na Modern Biology, por isso temos uma garantia de 100% de satisfação. Nossa equipe de especialistas está sempre pronta para ajudá-lo. Você precisa de mais ajuda para decidir quais experimentos são apropriados para sua classe? Confira nosso conveniente guia de planejamento de laboratório.


17.1: Biotecnologia - Biologia

REVISTA ELETRÔNICA DE BIOTECNOLOGIA

. MUDANDO DA CIÊNCIA PARA O DESENVOLVIMENTO.

As Cores da Biotecnologia: Ciência, Desenvolvimento e Humanidade

A biotecnologia e o mundo das cores sempre estiveram interligados. Matizes e matizes naturais são capturados em seu estado natural ou sintético em uma variedade de produtos de mercado. Os mercados de flores de rosas vermelho-sangue naturais e rosas azuis criadas por genes recentemente lançados no Japão são exemplos adequados.

Até o momento, apesar das técnicas inspiradoras de recorte e dobra da engenharia genética, o lendário & lsquo Black Tulip & rsquo do autor francês Alexandre Dumas ainda permanece o & lsquo Santo Graal do mundo das tulipas & rsquo. Vários tipos, de & lsquoTulipa Queen of Night & rsquo (1944) a T. & rsquoBlack Hero & rsquo (1984), constituem & lsquo a categoria de & lsquoblacka das tulipas oficialmente & lsquo roxas & rsquo & rsquo.

A riqueza de cores da natureza inspirou famosos pintores e poetas --- o francês Hilaire Belloc descreve em verso a morfologia de O Micróbio com suas sete caudas tufadas com muitos pontos rosa e roxos. & rsquo e crianças em idade escolar para explorar o mundo microbiano através do & lsquo espelho & rsquo da coluna Winogradsky & rsquos com suas faixas roxas e verdes --- consórcios das bactérias fotossintéticas verdes e roxas. As cianobactérias azul-esverdeadas contribuem para a economia dos ciclos biogeoquímicos importantes da Natureza e do ciclo do nitrogênio. O Mar Vermelho pode derivar sua cor e nome da cianobactéria vermelha - Trichodesmium erythraeum, mas a destruição de numerosos peixes é devido à população da Maré Vermelha de dinoflagelados marrom-avermelhados semelhantes a plantas. Os pigmentos ajudam a classificar os castanhos, amarelos, algas vermelhas e verdes e protozoários e leveduras como Euglena e Pichia. A arte da cor da Nature & rsquos ocorre em todo o bioespectro incorporando bactérias verdes e roxas interalia, espécies produtoras de antibióticos de Streptomyces e Nocardia, fungos que colorem queijos, anoles verde-azulados, mamão e truta arco-íris e proteínas fluorescentes verdes responsáveis ​​pela coloração de diversos corais e anêmonas. Cromoproteínas verdes, amarelas, laranja-vermelhas e roxas-azuis são a razão de ser das cores dos recifes lendários que variam no espectro das condições de luz do dia. Na verdade, a paleta de pigmentos e tintas da Nature & rsquos enfatiza a necessidade de centros de biorecursos para capturar, classificar e conservar o planeta & rsquos biotreasury para que a extinção não resulte de negligência benigna e exploração comercial.

& lsquoBiomimicry & hellip & hellip é uma nova ciência que estuda as melhores idéias da natureza e depois imita esses projetos e processos para resolver os problemas humanos. & hellip & hellipOrganisms usam dois métodos para criar cores sem tinta: pigmentos internos e a cor estrutural que torna as borboletas tropicais, pavões e beija-flores tão lindos. Um pavão é um pássaro completamente marrom. Seus & ldquocolours & rdquo resultam da dispersão de luz de bastões de melanina regularmente espaçados e efeitos de interferência através de finas camadas de queratina (a mesma coisa que suas unhas). & Rsquo

As novas roupas militares usam cores fluorescentes, biossensores e bioinformática em nível nano para imitar fenômenos naturais de biomimética e cores camaleônicas. Geofabrics coloridos para uso apropriado contribuem para a gestão urbana e paisagística --- conservação de campos de golfe e gramados de parques, e salvaguarda de taludes de solo e jardins floridos.

O instinto criativo e estético da humanidade está embutido em tecnologias limpas e verdes. O primeiro cartão de crédito verde biodegradável foi emitido em 1997. As proteínas & lsquoCoral acendem a luz vermelha & rsquo em águas marinhas e peixes brilhantes coloridos funcionam como indicadores de poluição em reservatórios aquáticos. As cores usadas em enxertos biotêxteis tornam o uso atraente e aceitável de materiais biocerâmicos em odontologia, medicina ortopédica, engenharia de tecidos e ciências veterinárias.

A pesquisa genética tem contribuído para a compreensão do olho humano e da cor da pele. A gênese das cores da pelagem de gatos, cães, coelhos, pôneis, etc. foi decifrada. A cor da cabeça dos pássaros também. Os alelos da cor da pelagem são usados ​​para produzir sub-linhas de camundongos para estudos relacionados ao envelhecimento, câncer, biologia cardiovascular, neurobiológica e reprodutiva. O rato Big Blue é usado para pesquisar câncer e doenças neurodegenerativas. Camundongos amarelos ajudam a localizar mutações genéticas em cromossomos específicos. Camundongos feitos sob medida - os modelos albino, creme, marrom e preto são chaves de pesquisa no estudo da biologia tumoral. De fato, & lsquothe capacidade de seguir as cores da pelagem & rsquo requer & lsquono ferramentas complicadas, como genotipagem molecular & rsquo na & lsquothe reprodução e manutenção de cepas mutantes & rsquo.

As cores inspiram, motivam e elevam a humanidade. As clínicas e instalações psicológicas usam cores suaves para ajudar os convalescentes. As cores também existem nos esportes. Os vencedores expressam um sentimento de conquista nacional e orgulho em ostentar suas bandeiras nacionais. No EURO 2004 & ndash futebol e biopsicologia se encontraram. Para aumentar a vantagem psicobiológica local e o patriotismo, o técnico do time da casa pediu aos torcedores & lsquoto que usassem algo vermelho ou verde & rsquo suas cores nacionais & lsquotoface as camisas laranja & rsquo de seus adversários & rsquo em uma partida de qualificação.

A biotecnologia corporativa está empenhada em & lsquochasing the rainbow. & rsquo O ex-vice-presidente Al Gore imaginou o & lsquopot de ouro no fim do arco-íris da biotecnologia. & rsquo Os empreendedores, entretanto, concentram sua busca & lsquo em algum lugar além do arco-íris genético & rsquo. Os formuladores de políticas da ONU usam códigos de cores no combate e na concepção de soluções para os problemas da fome e da pobreza. A Comissão Econômica da ONU para a África em 2002 descreveu & lsquoRealizing the Promise of Green Biotechnology for the Poor & rsquo and & lsquoTackling the Diseases of Poverty through Red Biotechnology & rsquo --- tecnologias que envolvem o uso de mosquitos geneticamente modificados com o potencial de erradicar a malária e alimentos geneticamente modificados - - arroz dourado e banana laranja, enriquecidos com vitamina A para combater o aparecimento de cegueira.

"Desafios éticos da biotecnologia verde para os países em desenvolvimento" surgem e, & lsquowhether plantas transgênicas devem carregar marcadores distintivos, como cores distintivas, para que possam ser identificadas e não misturadas com outras plantas da mesma espécie & rsquo está sob revisão para uso em trabalhos regulatórios. Na pesquisa de biologia espacial, plantas transgênicas usando as cores azul e verde estão sendo desenvolvidas como biossensores para indicar a presença de certos tipos de estresse.

Os nutricionistas falam de uma dieta arco-íris rica em micronutrientes e vitaminas que tornam os alimentos naturalmente atraentes e apetitosos para um bom estado de espírito. A medicina tradicional recomenda comer alimentos naturalmente coloridos contendo fitonutrientes naturais em seus ingredientes de pele. Uma escolha criteriosa de alimentos vermelhos (carnes), verdes (saladas), amarelos (cereais e frutas) e violetas (vegetais) contribui para o sustento de uma boa saúde a longo prazo no combate ao diabetes artificial e à obesidade. Queijo azul e trufas pretas são iguarias sem adição de corantes alimentares e os supermercados podem em breve oferecer cenouras em vermelho e roxo com a variedade de laranja. & lsquoA pesquisa em cenouras de cores diferentes não se trata de fazer uma declaração de moda, mas de melhorias potenciais para a saúde & rsquo.

No agro-comércio, as cores do tráfego âmbar e verde definem políticas que distorcem o comércio de certas mercadorias. As políticas da caixa âmbar significam & lsquo cautela & rsquo em relação a & lsquoprice apoios, empréstimos e subsídios de marketing e quantidades de gado & rsquo. As apólices da caixa verde cobrem & lsquoresearch, controle de pragas e doenças e programas de seguro e conservação de safras & rsquo. Políticas de caixa azul - uma categoria temporária da OMC que acomoda negociações transatlânticas, são políticas de caixa amarela definidas com relação a programas de limitação de produção & rsquo.

As biotecnologias descritas nas cores destacam os aspectos salientes da pesquisa para o desenvolvimento econômico. A Convenção Cordia-EuropaBio 2003 em Viena em & lsquo Blue Biotechnology - Exploração de Recursos Marinhos & rsquo enfocou o & lsquoOcean of Opportunities & rsquo para sustentar o desenvolvimento por meio do uso racional de recursos biológicos marinhos. O papel catalítico da Europa na & lsquo Green Biotechnology in Africa & rsquo reside na educação colaborativa de biotecnologia, pesquisa, desenvolvimento e empreendimentos de mercado.

Em janeiro de 2004, uma reunião da Comissão Europeia no Biosciences & lsquoTechnology Facility & rsquo, University of York, Reino Unido, reconheceu que qualquer plataforma & lsquobiotechnology que desenvolvesse produtos de base biológica teria que ser um casamento combinado do & lsquo White & rsquo com o & lsquo Green & rsquo e Setores de biotecnologia & lsquo Blue & rsquo & rsquo. O desbloqueio de gargalos pode ser alcançado por meio de programas que utilizem & lsquothe sinergias entre as biotecnologias verde, branca e azul. & Rsquo

Em 2005, o 12º Congresso Europeu de Biotecnologia usará 4 motores biotecnológicos: branco (industrial) vermelho (farmacêutico), verde (alimentos e rações) e azul (meio ambiente) em & lsquo Bringing Genomes to Life & rsquo na Dinamarca.

O uso de códigos de cores é aparentemente a língua franca da política científica na Alemanha. Sessenta por cento das 253 empresas de biotecnologia com cerca de 43.000 funcionários em uma pesquisa do Ministério da Economia de Hessen & rsquos eram especializadas em biotecnologia vermelha (diagnóstico e tratamento de doenças), 4% eram especializadas em biotecnologia verde (agricultura, produção de alimentos) e 1% era em biotecnologia cinza (processos industriais puros com nuances ambientais). Em Baden-W & uumlrttemberg, mais da metade das empresas de biotecnologia se destacam em biotecnologia vermelha, com números menores nos setores cinza e verde. Os estudos de mercado alemães enfatizam as biotecnologias branca e vermelha. A biotecnologia vermelha representa cerca de 86% de todas as empresas de biotecnologia. A biotecnologia verde com 27% é seguida pela biotecnologia cinza com 10%.

Nos EUA, um sistema de segurança com código de 5 cores de verde (baixo) a azul (protegido), amarelo (elevado) e laranja (alto) a vermelho (severo) foi decretado. A adoção de respostas de proteção e autodefesa envolve todos os níveis de vigilância e preparação para combater e neutralizar as ameaças do terrorismo e do bioterrorismo que visam à destruição da segurança daquele país e de seus povos. Os sistemas de alerta de cores para poluição do ar (EUA) e clima inclemente (Moçambique) são indicadores de tempo disponível para ações preventivas por pessoas suscetíveis a doenças asmáticas e respiratórias, bem como para compensar a perda de vidas e recursos bioeconômicos.

Na sátira, existe um alerta de vaca louca de nível & lsquo cinco (cores). Os níveis de alerta variam de comer partes de vacas (verdes) através do consumo limitado de carne (azul) e exercícios de medidas de proteção planejadas (amarelo) para mugir sintomático e ruminar (laranja) para uma mudança para alimento fermentado - tofu (vermelho).

O uso de cores para descrever a biotecnologia constitui um novo mecanismo em:

Dr. R. Colwell, Diretor da Fundação Nacional dos EUA em uma reunião de biotecnologia EUA-CE em 2003 disse: & ldquoSe pudéssemos tecer uma Bandeira da Biotecnologia, alguns dizem, ela apresentaria três cores: vermelho para aplicações médicas, verde para agrícolas e branco para industrial. Na verdade, essa bandeira pode acumular ainda mais cores com o tempo, à medida que a biotecnologia marinha e ambiental e outras aplicações adicionam suas listras & rsquo.

Nesse contexto, o índice de cores abaixo pode ser um guia útil com adições adicionais, pois a biotecnologia e as cores se entrelaçam ao longo do tempo na promoção da percepção pública e compreensão das aplicações da biotecnologia para a causa da ciência, do desenvolvimento e do futuro atual e pós-humano da humanidade.

Área de Atividades de Biotecnologia

Saúde, Medicina, Diagnóstico

Biotecnologia alimentar, ciência da nutrição

Aquicultura, biotecnologia costeira e marinha

Agrícola, ambiental, biotecnologia e biocombustíveis ndash, biofertilizantes, biorremediação, geomicrobiologia

Zona Árida e Biotecnologia do Deserto

Bioterrorismo, Biowarfare, Biocrimes, Guerra Anticrop

Patentes, publicações, invenções, DPIs

Fermentação Clássica e Tecnologia de Bioprocessos

Edgar J. DaSilva
Ex-diretor
Divisão de Ciências da Vida
UNESCO, Paris, França
[email protected]

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Departamento de Biologia

Professor de universidade
Victor e Gwendolyn Beinfield Professor de Biologia
Membro, Academia Nacional de Ciências dos EUA

Descrição da Pesquisa

Modulação de redes neurais

Um dos problemas fundamentais da neurociência é entender como o funcionamento do circuito surge das propriedades intrínsecas dos neurônios individuais e de suas conexões sinápticas. De particular interesse para nós hoje é até que ponto saídas de circuitos semelhantes podem ser geradas por múltiplos mecanismos, tanto em diferentes animais individuais, ou no mesmo animal ao longo de sua vida. Como uma preparação experimental, exploramos as vantagens dos circuitos geradores de padrões centrais no sistema nervoso estomatogástrico de crustáceos. Geradores de padrão central são grupos de neurônios encontrados nos sistemas nervosos de vertebrados e invertebrados responsáveis ​​pela geração de comportamentos rítmicos específicos, como caminhar, nadar e respirar. Os geradores de padrão central no gânglio estomatogástrico (STG) de lagostas e caranguejos são ideais para muitas análises porque o STG tem apenas cerca de 30 neurônios grandes, a conectividade é estabelecida, os neurônios são fáceis de registrar e quando o gânglio estomatogástrico é removido do animal, continua a produzir padrões motores rítmicos.

O trabalho no laboratório está centrado em três questões principais:

  1. Como os neuromoduladores e neurônios neuromoduladores reconfiguram os circuitos de modo que o mesmo grupo de neurônios possa produzir uma variedade de resultados comportamentais relevantes?
  2. Como as redes podem ser estáveis ​​ao longo da vida do animal, apesar da renovação contínua das proteínas da membrana, como canais e receptores? Como a estabilidade da rede é mantida por longos períodos de tempo? Em que medida as saídas de rede semelhantes resultam de diferentes mecanismos ou soluções subjacentes ?.
  3. Quão variáveis ​​são os conjuntos de parâmetros que governam a função do circuito entre os animais? Como os animais com conjuntos distintos de parâmetros de circuito podem responder de forma confiável a perturbações como neuromoduladores e temperatura?

Para responder a essas questões, empregamos técnicas eletrofisiológicas, biofísicas, computacionais, anatômicas, bioquímicas e moleculares.

Publicações selecionadas

Bronk, P., Kuklin, E.A., Gorur-Shandilya, S., Liu, C., Wiggin, T.D., Marder, E., e Griffith, L.C. (2018) A regulação de Eag por cálcio / calmodulina controla a excitabilidade pré-sináptica em & # 160DrosófilaJ. Neurophysiol., 119: 1665-1680. PMCID: PMC6008097.

Ori, H., Marder, E. e Marom, S. (2018) Função celular dada variação de parâmetro no modelo de Hodgkin-Huxley. & # 160Proc Natl Acad Sci (EUA), 115: E8211-E8218. doi.org/10.1073/pnas.180855115. PubMed Central PMCID: PMC6126753.

Rosenbaum P, Marder E. A transmissão gradativa sem potenciais de ação sustenta a atividade rítmica em alguns, mas não em todos os moduladores que ativam a mesma corrente. & # 160J. Neurosci.㺦: 8976-8988.

Haddad, S.A. e Marder, E. (2018) Circuit robustness to temperature perturbation is altered by neuromodulators. & # 160Neurônio, 100 :. 18 de setembro de 2018. pii: S0896-6273 (18) 30740-2. & # 160

Marder, Eve (2018) Autobiography. In: The History of Neuroscience in Autobiography, Society for Neuroscience, Volume 10, Albright, T.D. e Squire, L.R., eds. páginas 420-455.

Marder, Eve (2018) Foreward. In: Lessons from the Lobster, Eve Marder & # 8217s trabalham em neurociência. Nassim, C. MIT Press, Cambridge. Pp. ix-xi.

Otopalik, A. G., M. L. Goeritz, A. C. Sutton, T. Brookings, C. Guerini e E. Marder (2017). "Sintonia morfológica descuidada em neurônios identificados do gânglio estomatogástrico crustáceo." & # 160Elife. 6 de 2017: e22352.

Otopalik, A. G., A. C. Sutton, M. Banghart e E. Marder (2017). "Quando estruturas neuronais complexas podem não importar." & # 160Elife. 6 de 2017: e23508.

Marder, E., Gutierrez, G.J. e Nusbaum, M.P. (2017) Conectomas complicados: o acoplamento elétrico cria caminhos paralelos e degenera mecanismos de circuito. & # 160Dev. Neurobiol., 77: 597-609.

Otopalik, A.G., Lane, B., Schulz, D.J. e Marder, E. (2017) Innexin Expression in electrically coupled motor circuits. & # 160Neurosc Lett, 10.1016 / j.neulet.2017.07.016

Nusbaum, M.P., Blitz, D.M., e Marder, E. (2017) Functional consequences of neuropeptide / small molécula cotransmission. & # 160Nature Reviews Neuroscience, 18: 389-403.

Marder, E. (2017) Scientific Publishing: Beyond scoops to best Practices. & # 160eLife& # 1606: e30076. doi: 10.7554 / eLife.30076

Marder, E. (2017) A importância de lembrar. & # 160eLife& # 1606: e30599. & # 160 doi.org/10.7554/eLife.30599

Gjorgjieva J, Drion G, Marder E. Implicações computacionais da diversidade biofísica e múltiplas escalas de tempo em neurônios e sinapses para o desempenho do circuito. & # 160Curr Opin Neurobiol.�:44-52.

Clandinin, T. R. e E. Marder (2016). "Visão geral editorial: evolução e computação do microcircuito 2016." & # 160Curr Opin Neurobiol㺩: 188-190.

Marder, E., G. J. Gutierrez e M. P. Nusbaum (2016). "Conectomas complicados: o acoplamento elétrico cria caminhos paralelos e degenera mecanismos de circuito." & # 160Dev Neurobiol.& # 1602016 17 de junho.

Northcutt, A. J., K. M. Lett, V. B. Garcia, C. M. Diester, B. J. Lane, E. Marder e D. J. Schulz (2016). "Sequenciamento profundo de transcriptomas do sistema nervoso de dois crustáceos decápodes para caracterizar genes importantes para a função e modulação do circuito neural." & # 160BMC Genomics㺑(1): 868.

O'Leary, T. e E. Marder (2016). "Função neural robusta em termos de temperatura a partir da regulação do canal de íons dependente de atividade." & # 160Curr Biol㺚(21): 2935-2941.


Reconhecimentos

Agradecemos ao Dr. Shankar Balasubramanian da Universidade de Cambridge por realizar o mapeamento 5fC Dr. Chun-Xiao Song e Dr. Yibin Liu da Universidade de Oxford por aconselhar sobre PB-seq Dr. Christopher K. Glass e Dr. Marten Hoeksema no Universidade da Califórnia em San Diego por aconselhar sobre cultura BMDM Dr. Rahul M. Kohli da Universidade da Pensilvânia para discussão e Dra. Lana Saleh em New England Biolabs por fornecer proteínas TET recombinantes. Agradecemos a Cheryl Kim e à equipe do núcleo de citometria de fluxo LJI (D. Hinz, S. Ellis, C. Dillingham, S. Sehic, M. Haynes e L. Nosworthy) pela ajuda com a classificação de células e ao núcleo de sequenciamento LJI Next Generation (J. Day, S. Alarcon, C. Kim, K. Tanguay e H. Dose) pela ajuda com o sequenciamento.

Histórico de resenhas

O histórico de revisão está disponível como arquivo adicional 5.

Informação de revisão por pares

Wenjing Ela foi a editora principal deste artigo e administrou seu processo editorial e revisão por pares em colaboração com o resto da equipe editorial.


Leia (biologia)

No sequenciamento de DNA, um leitura é uma sequência inferida de pares de bases (ou probabilidades de pares de bases) correspondendo a todo ou parte de um único fragmento de DNA. Um experimento de sequenciamento típico envolve a fragmentação do genoma em milhões de moléculas, que são selecionadas por tamanho e ligadas a adaptadores. O conjunto de fragmentos é conhecido como uma biblioteca de sequenciamento, que é sequenciada para produzir um conjunto de leituras. [1]

As tecnologias de sequenciamento variam na duração das leituras produzidas. Leituras de comprimento de 20-40 pares de bases (bp) são chamadas de ultracurtas. [2] Sequenciadores típicos produzem comprimentos de leitura na faixa de 100-500 bp. [3] No entanto, as plataformas da Pacific Biosciences produzem comprimentos de leitura de aproximadamente 1500 bp. [4] O comprimento da leitura é um fator que pode afetar os resultados dos estudos biológicos. [5] Por exemplo, comprimentos de leitura mais longos melhoram a resolução de de novo montagem do genoma e detecção de variantes estruturais. Estima-se que comprimentos de leitura superiores a 100 quilobases (kb) serão necessários para a rotina de novo montagem do genoma humano. [6] Os pipelines de bioinformática para analisar dados de sequenciamento geralmente levam em consideração os comprimentos de leitura. [7]


Assista o vídeo: BIOTECNOLOGIA. Biologia com Samuel Cunha (Agosto 2022).